Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXZ0

Ctxn3, Cortexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn3Q8BXZ0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctxn3Q8BXZ0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctxn3Q8BXZ0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctxn3Q8BXZ0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctxn3Q8BXZ0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctxn3Q8BXZ0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctxn3Q8BXZ0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctxn3Q8BXZ0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctxn3Q8BXZ0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctxn3Q8BXZ0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctxn3Q8BXZ0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctxn3Q8BXZ0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctxn3Q8BXZ0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctxn3Q8BXZ0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctxn3Q8BXZ0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctxn3Q8BXZ0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctxn3Q8BXZ0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms