Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Cldn17Q8BXA6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Cldn17Q8BXA6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Cldn17Q8BXA6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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