Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbbp5Q8BX09 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms