Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdsp2Q8BX07 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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