Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms