Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTU1

Cfap20, Cilia- and flagella-associated protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap20Q8BTU1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap20Q8BTU1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap20Q8BTU1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap20Q8BTU1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap20Q8BTU1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Cfap20Q8BTU1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap20Q8BTU1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms