Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup54Q8BTS4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms