Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf18Q8BM39 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf18Q8BM39 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf18Q8BM39 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf18Q8BM39 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf18Q8BM39 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf18Q8BM39 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf18Q8BM39 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf18Q8BM39 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf18Q8BM39 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf18Q8BM39 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf18Q8BM39 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf18Q8BM39 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf18Q8BM39 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf18Q8BM39 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf18Q8BM39 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf18Q8BM39 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf18Q8BM39 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf18Q8BM39 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf18Q8BM39 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf18Q8BM39 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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Prpf18Q8BM39 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Prpf18Q8BM39 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf18Q8BM39 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
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Prpf18Q8BM39 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf18Q8BM39 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf18Q8BM39 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf18Q8BM39 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf18Q8BM39 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf18Q8BM39 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf18Q8BM39 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf18Q8BM39 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf18Q8BM39 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Prpf18Q8BM39 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.04■□□□□ -0
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Prpf18Q8BM39 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Prpf18Q8BM39 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prpf18Q8BM39 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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