Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Atg4dQ8BGV9 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Atg4dQ8BGV9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Atg4dQ8BGV9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Atg4dQ8BGV9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Atg4dQ8BGV9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Atg4dQ8BGV9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Atg4dQ8BGV9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Atg4dQ8BGV9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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