Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGT7

Smndc1, Survival of motor neuron-related-splicing factor 30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smndc1Q8BGT7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smndc1Q8BGT7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms