Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
U2af1l4Q8BGJ9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
U2af1l4Q8BGJ9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
U2af1l4Q8BGJ9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
U2af1l4Q8BGJ9 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
U2af1l4Q8BGJ9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
U2af1l4Q8BGJ9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
U2af1l4Q8BGJ9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
U2af1l4Q8BGJ9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
U2af1l4Q8BGJ9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
U2af1l4Q8BGJ9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
U2af1l4Q8BGJ9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
U2af1l4Q8BGJ9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
U2af1l4Q8BGJ9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
U2af1l4Q8BGJ9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
U2af1l4Q8BGJ9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
U2af1l4Q8BGJ9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
U2af1l4Q8BGJ9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
U2af1l4Q8BGJ9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
U2af1l4Q8BGJ9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
U2af1l4Q8BGJ9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
U2af1l4Q8BGJ9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
U2af1l4Q8BGJ9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
U2af1l4Q8BGJ9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
U2af1l4Q8BGJ9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
U2af1l4Q8BGJ9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
U2af1l4Q8BGJ9 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms