Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFS6

Cpped1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpped1Q8BFS6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpped1Q8BFS6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpped1Q8BFS6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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