Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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