Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Amigo1Q80ZD8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Amigo1Q80ZD8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Amigo1Q80ZD8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Amigo1Q80ZD8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Amigo1Q80ZD8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Amigo1Q80ZD8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Amigo1Q80ZD8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Amigo1Q80ZD8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Amigo1Q80ZD8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Amigo1Q80ZD8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Amigo1Q80ZD8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Amigo1Q80ZD8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Amigo1Q80ZD8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Amigo1Q80ZD8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Amigo1Q80ZD8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Amigo1Q80ZD8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Amigo1Q80ZD8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Amigo1Q80ZD8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Amigo1Q80ZD8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Amigo1Q80ZD8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Amigo1Q80ZD8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Amigo1Q80ZD8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Amigo1Q80ZD8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Amigo1Q80ZD8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Amigo1Q80ZD8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Amigo1Q80ZD8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Amigo1Q80ZD8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Amigo1Q80ZD8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Amigo1Q80ZD8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Amigo1Q80ZD8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Amigo1Q80ZD8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Amigo1Q80ZD8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Amigo1Q80ZD8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Amigo1Q80ZD8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Amigo1Q80ZD8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Amigo1Q80ZD8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Amigo1Q80ZD8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Amigo1Q80ZD8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Amigo1Q80ZD8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Amigo1Q80ZD8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Amigo1Q80ZD8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Amigo1Q80ZD8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Amigo1Q80ZD8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Amigo1Q80ZD8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Amigo1Q80ZD8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Amigo1Q80ZD8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Amigo1Q80ZD8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Amigo1Q80ZD8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Amigo1Q80ZD8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Amigo1Q80ZD8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Amigo1Q80ZD8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Amigo1Q80ZD8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Amigo1Q80ZD8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Amigo1Q80ZD8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Amigo1Q80ZD8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Amigo1Q80ZD8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Amigo1Q80ZD8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Amigo1Q80ZD8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo1Q80ZD8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo1Q80ZD8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo1Q80ZD8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo1Q80ZD8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo1Q80ZD8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo1Q80ZD8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo1Q80ZD8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo1Q80ZD8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo1Q80ZD8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo1Q80ZD8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo1Q80ZD8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo1Q80ZD8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo1Q80ZD8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo1Q80ZD8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo1Q80ZD8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo1Q80ZD8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo1Q80ZD8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms