Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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