Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS5

Lrrc27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc27Q80YS5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lrrc27Q80YS5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms