Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp8Q80YR6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp8Q80YR6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms