Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms