Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSK3

Pcdh8, Protocadherin-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh8Q7TSK3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms