Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH3

Znf516, Zinc finger protein 516, mousemouse

Predictions only

Length 1,157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf516Q7TSH3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Tcrg-V1-201ENSMUST00000103564 374 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 2310040G07Rik-202ENSMUST00000145897 462 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 6030460B20Rik-201ENSMUST00000191764 1058 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 AC118750.1-201ENSMUST00000214163 675 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 AC168059.2-201ENSMUST00000224473 333 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Olfr1171-ps1-202ENSMUST00000150178 1398 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Gm11656-201ENSMUST00000137462 395 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Gm19253-201ENSMUST00000204279 307 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Timm21-201ENSMUST00000025547 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Gm4207-201ENSMUST00000173144 960 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Pou1f1-205ENSMUST00000184525 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms