Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctdp1Q7TSG2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms