Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Dsg1bQ7TSF1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Dsg1bQ7TSF1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Dsg1bQ7TSF1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Dsg1bQ7TSF1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
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Dsg1bQ7TSF1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Dsg1bQ7TSF1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Dsg1bQ7TSF1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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