Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS58

Clec4b1, Antigen presenting cell lectin-like receptor A2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4b1Q7TS58 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms