Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms