Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sys1Q78S06 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms