Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU7

Gypc, Glycophorin-C, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypcQ78HU7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GypcQ78HU7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GypcQ78HU7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GypcQ78HU7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GypcQ78HU7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GypcQ78HU7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GypcQ78HU7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GypcQ78HU7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GypcQ78HU7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GypcQ78HU7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GypcQ78HU7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GypcQ78HU7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GypcQ78HU7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GypcQ78HU7 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GypcQ78HU7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GypcQ78HU7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GypcQ78HU7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GypcQ78HU7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GypcQ78HU7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GypcQ78HU7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GypcQ78HU7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GypcQ78HU7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GypcQ78HU7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GypcQ78HU7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GypcQ78HU7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GypcQ78HU7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GypcQ78HU7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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