Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SynmQ70IV5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SynmQ70IV5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms