Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWY6

Ube2d2b, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2B, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d2bQ6ZWY6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms