Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SpopQ6ZWS8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms