Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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NinlQ6ZQ12 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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NinlQ6ZQ12 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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NinlQ6ZQ12 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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NinlQ6ZQ12 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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NinlQ6ZQ12 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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NinlQ6ZQ12 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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NinlQ6ZQ12 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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NinlQ6ZQ12 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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NinlQ6ZQ12 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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NinlQ6ZQ12 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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NinlQ6ZQ12 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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NinlQ6ZQ12 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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NinlQ6ZQ12 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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NinlQ6ZQ12 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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NinlQ6ZQ12 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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NinlQ6ZQ12 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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NinlQ6ZQ12 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NinlQ6ZQ12 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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