Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc44a1Q6X893 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms