Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms