Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gja6Q6S5G4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gja6Q6S5G4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gja6Q6S5G4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gja6Q6S5G4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gja6Q6S5G4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gja6Q6S5G4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gja6Q6S5G4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gja6Q6S5G4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gja6Q6S5G4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms