Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms