Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf4Q6PFF0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms