Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Tmeff1Q6PFE7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Tmeff1Q6PFE7 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Tmeff1Q6PFE7 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Tmeff1Q6PFE7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Tmeff1Q6PFE7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Tmeff1Q6PFE7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Tmeff1Q6PFE7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmeff1Q6PFE7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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