Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS3

Sarm1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sarm1Q6PDS3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sarm1Q6PDS3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sarm1Q6PDS3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms