Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Trak1Q6PD31 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trak1Q6PD31 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms