Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX7

Rgma, Repulsive guidance molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmaQ6PCX7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RgmaQ6PCX7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RgmaQ6PCX7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RgmaQ6PCX7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RgmaQ6PCX7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RgmaQ6PCX7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RgmaQ6PCX7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RgmaQ6PCX7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RgmaQ6PCX7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RgmaQ6PCX7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RgmaQ6PCX7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RgmaQ6PCX7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RgmaQ6PCX7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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RgmaQ6PCX7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RgmaQ6PCX7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RgmaQ6PCX7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RgmaQ6PCX7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RgmaQ6PCX7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RgmaQ6PCX7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RgmaQ6PCX7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RgmaQ6PCX7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RgmaQ6PCX7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RgmaQ6PCX7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RgmaQ6PCX7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RgmaQ6PCX7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RgmaQ6PCX7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RgmaQ6PCX7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RgmaQ6PCX7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RgmaQ6PCX7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RgmaQ6PCX7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RgmaQ6PCX7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RgmaQ6PCX7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RgmaQ6PCX7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RgmaQ6PCX7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RgmaQ6PCX7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RgmaQ6PCX7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RgmaQ6PCX7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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RgmaQ6PCX7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RgmaQ6PCX7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RgmaQ6PCX7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RgmaQ6PCX7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RgmaQ6PCX7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RgmaQ6PCX7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RgmaQ6PCX7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RgmaQ6PCX7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RgmaQ6PCX7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RgmaQ6PCX7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RgmaQ6PCX7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RgmaQ6PCX7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RgmaQ6PCX7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RgmaQ6PCX7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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RgmaQ6PCX7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RgmaQ6PCX7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RgmaQ6PCX7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RgmaQ6PCX7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RgmaQ6PCX7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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RgmaQ6PCX7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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RgmaQ6PCX7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RgmaQ6PCX7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RgmaQ6PCX7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RgmaQ6PCX7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RgmaQ6PCX7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RgmaQ6PCX7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RgmaQ6PCX7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RgmaQ6PCX7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RgmaQ6PCX7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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