Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atl2Q6PA06 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms