Protein–RNA interactions for Protein: Q6P539

Fam222b, Protein FAM222B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam222bQ6P539 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam222bQ6P539 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms