Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A1

Stmnd1, Stathmin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stmnd1Q6P3A1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms