Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SphkapQ6NSW3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SphkapQ6NSW3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms