Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ParpbpQ6IRT3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ParpbpQ6IRT3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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