Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nop58Q6DFW4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nop58Q6DFW4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms