Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q6DFW0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q6DFW0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q6DFW0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q6DFW0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q6DFW0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q6DFW0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q6DFW0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q6DFW0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q6DFW0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q6DFW0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q6DFW0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q6DFW0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q6DFW0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q6DFW0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q6DFW0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q6DFW0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q6DFW0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q6DFW0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q6DFW0 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q6DFW0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q6DFW0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q6DFW0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q6DFW0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q6DFW0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q6DFW0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q6DFW0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q6DFW0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q6DFW0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q6DFW0 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q6DFW0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q6DFW0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q6DFW0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q6DFW0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6DFW0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q6DFW0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms