Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms