Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk13Q69ZA1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk13Q69ZA1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk13Q69ZA1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk13Q69ZA1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk13Q69ZA1 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk13Q69ZA1 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk13Q69ZA1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk13Q69ZA1 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk13Q69ZA1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk13Q69ZA1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk13Q69ZA1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk13Q69ZA1 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk13Q69ZA1 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk13Q69ZA1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk13Q69ZA1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk13Q69ZA1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk13Q69ZA1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk13Q69ZA1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk13Q69ZA1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk13Q69ZA1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk13Q69ZA1 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk13Q69ZA1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk13Q69ZA1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk13Q69ZA1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk13Q69ZA1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk13Q69ZA1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk13Q69ZA1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk13Q69ZA1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk13Q69ZA1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk13Q69ZA1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk13Q69ZA1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk13Q69ZA1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk13Q69ZA1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk13Q69ZA1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk13Q69ZA1 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk13Q69ZA1 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk13Q69ZA1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk13Q69ZA1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk13Q69ZA1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk13Q69ZA1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk13Q69ZA1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk13Q69ZA1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk13Q69ZA1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk13Q69ZA1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms