Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms