Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ino80dQ66JY2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ino80dQ66JY2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ino80dQ66JY2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ino80dQ66JY2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ino80dQ66JY2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ino80dQ66JY2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ino80dQ66JY2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ino80dQ66JY2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ino80dQ66JY2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ino80dQ66JY2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ino80dQ66JY2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ino80dQ66JY2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ino80dQ66JY2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ino80dQ66JY2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ino80dQ66JY2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ino80dQ66JY2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ino80dQ66JY2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ino80dQ66JY2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ino80dQ66JY2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ino80dQ66JY2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ino80dQ66JY2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ino80dQ66JY2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ino80dQ66JY2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ino80dQ66JY2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ino80dQ66JY2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ino80dQ66JY2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ino80dQ66JY2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ino80dQ66JY2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ino80dQ66JY2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ino80dQ66JY2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ino80dQ66JY2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ino80dQ66JY2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ino80dQ66JY2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ino80dQ66JY2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ino80dQ66JY2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ino80dQ66JY2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ino80dQ66JY2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ino80dQ66JY2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ino80dQ66JY2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ino80dQ66JY2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ino80dQ66JY2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ino80dQ66JY2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ino80dQ66JY2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ino80dQ66JY2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ino80dQ66JY2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ino80dQ66JY2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ino80dQ66JY2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ino80dQ66JY2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ino80dQ66JY2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ino80dQ66JY2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ino80dQ66JY2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ino80dQ66JY2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ino80dQ66JY2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ino80dQ66JY2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms